如果您收到提示说您的证件在12306系统里已经被注册过，可能有以下几种情况。
1、您的证件可能已经被其他人注册过了，在这种情况下，您应该立即联系相关机构或网站客服，确认证件是否被他人盗用，您也应该尽快前往公安局报案，防止证件被进一步滥用。
2、如果您曾经在其他地方或时间使用该证件注册过账号，可能信息被同步到了12306系统里，您可以尝试使用已注册账号登录，或者联系客服寻求帮助。
3、有可能是系统出现了错误或者误判，您可以尝试重新注册，如果仍然遇到问题，可以联系客服协助解决。
为了解决这个问题，您可以尝试以下步骤：
1、确认证件是否遗失或被他人盗用，及时报警并联系相关机构。
2、联系12306客服，提供您的证件信息和相关情况，寻求帮助解决问题。
3、如果确定需要重新注册，尝试清理浏览器缓存和cookies，然后重新尝试注册。
如果您的证件在12306系统里被注册过，应该及时采取措施，联系相关机构或网站客服解决问题，确保个人信息的安全。
