注册个体户和注册公司之间存在以下主要差异。
1、性质不同：个体户的性质更接近于个人独资企业，而公司则属于独立的法人主体，这意味着个体户的投资人对于企业的债务承担无限责任，而公司的股东则承担有限责任，个体户无法像公司那样拥有有限责任保护机制，个体户不具备法人资格，而公司则拥有法人资格，这意味着公司可以参与政府采购和招投标等活动，而个体户则无法参与这些活动，公司可以申请多项资质和许可，而个体户在这方面受到更多限制。
2、承担的责任不同：个体户无法做到像公司那样实现风险隔离，一旦经营过程中发生任何风险或债务问题，经营者需要承担全部责任，而公司则可以通过法人治理结构实现风险隔离，股东对公司的债务承担有限责任，个体户在经营过程中需要承担更大的风险，个体户无法设立分支机构或对外投资其他企业，如果个体户的经营者想要扩大规模或拓展业务，只能通过转让或变更经营者来实现，而公司则可以通过成立分公司或对外投资的方式来实现扩张。
3、纳税及税务方面的要求不同：个体户在税务方面相对简单一些，但也需要缴纳相应的税款，而公司在税务方面需要遵守更多的规定和要求，包括申报纳税、缴纳企业所得税等，个体户在开具发票方面相对困难一些，需要开具发票时可能需要通过个人名义去税务局申请代开，而公司则可以根据业务需要开具相应的发票，个体户在税务优惠方面可能不如公司灵活多样，虽然个体户可以享受一定的税收优惠政策，但这些政策可能不如针对公司的政策那样全面和灵活，在选择注册类型时需要根据具体情况进行综合考虑和评估。
注册个体户和公司之间存在多方面的差异包括性质、承担的责任、税务要求等，在选择注册类型时需要根据具体情况进行综合考虑和评估以便选择最适合自己的经营方式并最大限度地降低经营风险和保护个人财产权益，如有更多疑问可以咨询专业律师获取专业解答。
