注册公司时，注册资本填写为100万和500万主要的区别体现在以下几个方面。
1、责任和风险：虽然都是有限责任公司，但注册资本越高，股东承担的责任和风险相对越大，这意味着如果公司因为股东出资不到位或者经营不善导致破产，股东需要按照其认缴的出资额来承担相应责任，注册资本为500万的公司股东承担的责任和风险相对较大。
2、公司规模和发展方向：虽然注册资本不能代表公司的真实经营能力和盈利能力，但它可以在一定程度上反映公司的规模和发展方向，注册资本为500万的公司可能被认为规模相对较大，可能在某些业务领域内具有较强的竞争力，这并非绝对，因为公司的规模和发展方向还受到其他多种因素的影响。
3、信誉度和信任度：在某些业务合作和招标过程中，合作伙伴或招标方可能会关注公司的注册资本，注册资本为500万的公司可能会获得更多信任，但这并非决定性因素，公司的信誉和口碑同样重要。
4、手续费用：在注册公司时，需要缴纳一定的注册费用，虽然注册费用与注册资本有一定关系，但并非按比例增加，注册资本从100万增加到500万，其手续费用可能并不会成倍增加。
注册资本为100万和500万的公司之间存在一定的差异，主要体现在责任风险、公司规模、信誉度和信任度以及手续费用等方面，这些差异并非绝对，公司在选择注册资本时应结合实际情况进行考虑。
