个体工商户注册税务登记证书的流程如下。
1、办理工商营业执照，领取营业执照后，到当地质量技术监督管理局办理组织机构代码证，之后到当地税务局办理税务登记，携带营业执照、组织机构代码证复印件，法定代表人身份证复印件以及开户银行许可证复印件到税务局办理税务登记手续。
2、办理税务登记手续时，需要填写税务登记表并提交相关证件资料，税务部门会审核企业提交的资料是否齐全并进行现场核实，如果资料齐全并且符合相关标准，税务部门会颁发税务登记证正本和副本，还会向纳税人发放税务登记证件标志。
个体工商户还需要进行实名认证和开通电子税务局等步骤，实名认证可以通过手机APP进行验证或到办税大厅进行身份验证，开通电子税务局后，可以通过网络进行申报纳税等涉税事项，具体流程可能会因地区不同而有所差异，建议咨询当地相关部门或机构以获得准确信息，以上内容仅供参考，具体流程和所需材料可以咨询当地工商部门获取。
