注册企业小规模与一般纳税人在多个方面存在显著区别，具体如下。
1、认定条件：小规模企业通常指年应税销售额在认定或登记为增值税纳税人后不超过500万元的企业，一般纳税人则是年应税销售额超过该标准的企业，小规模企业在会计核算和财务管理上相对简单，而一般纳税人需要具备更加完善的财务管理体系。
2、税收管理：小规模企业通常按照简易计税方式，增值税税率一般为3%，且计税依据为不含税的销售额，一般纳税人则适用更为复杂的增值税制度，税率根据行业不同有所区别，计税依据包括应税销售额和应税服务收入等，一般纳税人可以享受抵扣进项税额的优惠政策，降低税负。
3、发票使用：小规模企业可以申请使用普通发票或增值税专用发票，但一般只能使用普通发票，一般纳税人则可以申请使用增值税专用发票，以便进行进项税额的抵扣。
4、财务和账务处理：小规模企业的财务处理相对简单，会计核算较为简化，一般纳税人则需要建立完善的财务管理体系，包括会计核算、报表编制等，以满足税务部门的管理要求。
5、纳税成本：小规模企业的纳税成本相对较低，因为税率较低且核算简单，一般纳税人由于涉及到更多的税种和更复杂的核算方式，纳税成本相对较高。
注册企业小规模与一般纳税人的主要区别在于认定条件、税收管理、发票使用、财务和账务处理以及纳税成本等方面，企业应根据自身情况选择合适的纳税方式，如有更多疑问，建议咨询专业税务人员或机构。
