注册公司的委托代理人是否会上黑名单，取决于多种因素，包括代理人的行为规范、是否遵守法律法规以及是否存在不当行为等。
如果代理人在代理过程中存在违法行为或者不当行为，比如提供虚假信息、隐瞒重要事实等违规行为，被相关部门查实并处理，那么就有可能会被列入某种“黑名单”或受到其他相应的处罚。
如果代理人遵守法律法规，诚实守信地履行职责，就不会被列黑名单，作为委托代理人，应该始终遵守法律法规，保持诚实守信，尽职尽责地为公司注册等代理事务提供服务。
仅供参考，建议咨询法律专业人士以获得更权威准确的解答，也请注意，各地的政策和实施可能会有所不同，具体还需结合当地的相关法律法规来判断。
