公司注册在外地，社保缴纳的方式会因公司的性质、员工所在地等因素而有所不同。一般来说，有以下几种方式可以参考。
1、公司委托第三方机构代为缴纳：公司可以选择委托当地的社保代理机构代为缴纳员工的社保费用，这种方式需要公司与代理机构签订协议，并确保代理机构具备合法资质和信誉度。
2、公司自行缴纳：如果公司在当地有分支机构或办公地点，并且符合当地的社保缴纳政策，公司可以自行在当地缴纳员工的社保费用，此时需要了解当地的社保政策和规定，并按照要求及时缴纳相关费用。
3、员工自行缴纳：对于部分灵活办公的员工，公司可以与员工达成协议，由员工自行在当地缴纳个人社保费用，这种情况下，公司需要确保员工能够按时缴纳费用，并保证员工的社保权益得到保障。
无论采用哪种方式，公司都需要确保员工的社保权益得到保障，遵守当地的社保政策和规定，公司需要建立完善的社保管理制度，确保社保缴纳及时、准确、规范，避免因社保问题带来的风险，建议您在操作过程中咨询当地的人力资源和社会保障部门，获取最准确的信息和指导。
