将商铺租给别人注册公司可能会带来以下风险。
1、租户经营风险：租户在商铺上注册公司后，其经营状况直接影响到房东的出租收益，如果租户经营不善，可能会导致商铺空置，甚至拖欠租金，给房东带来经济损失。
2、法规风险：租户在经营过程中需要遵守相关法律法规，如未达到相关资质标准、违规经营等，可能会受到相关部门的处罚，甚至可能涉及法律纠纷，这些风险可能波及房东，影响房东的声誉和利益。
3、注册手续风险：租户在商铺注册公司时，需要办理相关手续，如果租户未能按照相关规定办理手续或提交的资料不真实，可能会导致相关部门对商铺进行处罚或限制其经营。
4、转让风险：如果未来房东需要将商铺转让给他人，有租户正在经营的公司可能会影响到转让的顺利进行，租户的公司可能存在未解决的合同问题、债务纠纷等，这些问题可能会影响到商铺的转让价值。
为了减少这些风险，房东在出租商铺时应该充分了解租户的资质和经营计划，签订详细的租赁合同并约定违约责任，要求租户在注册公司时遵守相关法律法规，确保租户的合法经营，房东还可以要求租户提供一定的担保或保证金来降低风险。
仅供参考，并不构成专业法律建议，如有需要，建议咨询专业律师以获取更详细和准确的建议。
