以公司名义注册淘宝账号并不违法。事实上，很多企业在淘宝开店都是以公司名义注册的。这样做不仅合法，而且可以提升店铺的信誉度，因为公司一般具有更完善的资质和运营体系。
但如果出现违反淘宝相关规定的情况，处理方式会根据具体的违规情况有所不同，以下是一些常见的处理方式：
1、了解违规原因：需要弄清楚违规的具体原因，这可以通过查看淘宝的违规通知或者联系淘宝客服来了解。
2、改正违规行为：根据违规原因，采取相应的措施进行改正，如果是商品描述不准确，就修改商品描述；如果是售后服务不到位，就改进售后服务等。
3、提交申诉：如果认为淘宝的处罚存在误判，可以通过淘宝提供的申诉渠道进行申诉。
4、接受处罚：如果确实存在违规行为，就需要接受淘宝的处罚，比如扣分、罚款、下架商品等。
5、寻求法律援助：如果对公司名义注册的淘宝账号的合规性有疑问，或者对淘宝的处罚有严重异议，可以寻求法律援助，咨询专业律师的意见。
具体的处理方式可能会因违规情况的不同而有所变化，在遇到问题时，建议及时联系淘宝客服或者专业律师进行咨询。
