申请注册公司程序代理的步骤如下。
1、确定公司名称并进行核名。
2、确定公司的注册地址和注册资金，注册地址需要是真实有效的地址，并且需要提供相关的证明材料，注册资金不需要实际缴纳，只需在注册时填写一定数额即可。
3、准备公司的经营范围和股东信息，并提交给工商局进行工商注册登记申请。
4、申请通过后，需准备相关材料到工商局领取营业执照，领取执照后，前往已备案的刻章点刻制公司公章、财务章、合同章等必要印章，还需到银行开立公司基本账户和纳税账户。
5、完成代理记账工作之前，需要与公司法人签署授权委托书，明确代理记账公司的职责和权利，然后由代理记账公司代为办理相关事务，包括建立账簿、出具报表等，代理公司还需要协助企业进行日常票据的整理以及日常财税咨询等。
流程可能会因地区差异和政策变化而有所不同，建议在进行注册公司程序代理前咨询当地相关部门或专业机构，以确保流程准确和顺利。
