一个老板注册两家公司发工资的做法是可行的，但需要遵守相关法律法规和税务规定。在这种情况下，老板需要确保两家公司的业务是独立的，并且遵守相关的税务和劳动法规定。
老板需要在两家公司中分别进行工资核算和报税，对于每个员工，他们的工资需要按照相应的税法规定进行个人所得税的缴纳，老板需要确保两家公司的业务是合法的，并且遵守相关的商业道德和法律法规，为了避免利益输送和关联交易等问题，老板还需要确保两家公司之间的业务往来是透明和合规的。
需要注意的是，这种做法可能会涉及到一些风险和挑战，如果两家公司的业务重叠或者存在关联关系，可能会引起税务部门的关注和审查，如果老板在两家公司发工资的过程中存在违规行为，例如虚报工资或者违反劳动法规定等，将会面临法律风险和声誉损失，老板需要谨慎考虑这种做法的可行性和风险，并确保遵守相关法律法规和道德准则。
