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注册会计师对被审计单位的存货进行审计时，主要目的是确认存货的数量和价值的准确性，以及存货的会计记录是否真实、完整。审计过程中，注册会计师会关注以下几个方面。
1、存货的数量：审计员会检查被审计单位的存货数量是否准确，这通常通过检查存货的盘点记录、存货的入库和出库记录以及存货的计量和测试等方式来完成，审计员还会关注是否存在存货过多或过少的情况，这可能会影响公司的财务状况和运营效率。
2、存货的价值：审计员会确认存货的价值是否准确，这包括确认存货的计价方法和会计政策是否符合相关会计准则和规定，以及存货的成本核算是否准确等，审计员还会关注存货的损耗和报废情况，以确保这些损失被正确处理并反映在财务报表中。
3、存货的会计记录：审计员会检查被审计单位的存货会计记录是否真实、完整，这包括检查存货的账簿、凭证、报表等，确认这些记录是否准确反映了公司的存货情况，审计员还会关注是否存在不当的会计处理，如虚构存货、错误分类等。
4、存货的内部控制：审计员会评估被审计单位的内部控制系统是否健全有效，特别是在存货管理方面，这包括评估内部控制系统的设计和执行是否有效，以及是否存在任何可能导致存货管理不善的问题。
注册会计师对被审计单位的存货进行审计时，需要综合考虑多个方面，以确保被审计单位的财务报表真实、准确地反映了公司的财务状况和运营成果。