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如果您的自住房被别人注册了公司，您需要采取一系列步骤来解决问题并注销该公司。以下是您可以遵循的一般步骤。
1、收集证据：您需要收集所有相关证据，证明该房屋是您的，并且别人在未经您同意的情况下注册了公司，这些证据可以包括房产证、购房合同、身份证等。
2、联系当地工商行政管理部门：将您所掌握的证据提交给当地的工商行政管理部门，并说明您的情况，他们将会对此展开调查，并可能要求您提供更多证据来支持您的主张。
3、寻求法律帮助：如果工商行政管理部门无法解决问题，或者您需要采取更进一步的行动来注销公司，那么您可以寻求法律帮助，请咨询律师以获取专业建议，并了解您的法律权利。
4、申请注销公司：如果您能够证明自己是该房屋的合法所有者，并且别人在您的房屋上注册的公司是非法存在的，您可以向当地工商行政管理部门申请注销该公司，注销程序可能因地区而异，您需要遵循当地的程序和要求。
5、采取必要措施保护自己的权益：在注销公司的过程中，您需要采取措施保护自己的权益，这可能包括要求赔偿、要求对方停止在您的房屋上经营公司等。
需要注意的是，注销公司是一项复杂的任务，需要遵循当地的法律程序和要求，建议您在采取任何行动之前咨询当地的律师或相关机构，以确保您的权益得到保护。