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注册公司开发票和不开发票的区别主要体现在以下几个方面。
1、税务处理：公司注册后，需要向税务部门申报纳税，如果公司提供了商品销售或劳务服务并开具发票，便可以依法申报纳税，享受相应的税收优惠政策，如果不开发票，可能会面临税务违规的风险，如漏税、逃税等。
2、财务记录：开发票可以明确记录公司的收入和支出，便于财务管理和核算，不开票的收支可能无法纳入财务记录，导致公司财务状况的不透明，不利于管理和决策。
3、合法合规：开发票可以确保公司的业务合规合法，避免因无票交易导致的各种纠纷和法律问题，不开发票可能会使公司在法律纠纷中处于不利地位。
4、客户信任度：对于客户来说，正规发票是证明交易合法性的重要凭证，有助于建立客户对公司的信任，长期不开发票可能会影响公司的信誉和形象，进而影响业务的发展。
5、具体开票与不开票的业务影响：在某些情况下，如提供劳务服务但未签订正式合同，或者销售商品但未达成交易等，可能不需要开具发票，但对于大部分正规业务往来，开具发票是必要的，开发票还可以作为公司财务报销的依据。
注册公司后开发票有助于公司合法合规运营，便于财务管理和税务处理，有助于建立客户信任度，不开发票可能会带来诸多风险和不便，以上内容仅供参考，具体情况可能因公司实际情况而异，建议咨询专业财务或法律人士以获取更具针对性的建议。