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自媒体注册商标应该注册第35类商标。

这类商标主要包括广告、商业经营、商业管理、办公事务等类别，自媒体属于服务型行业，主要提供内容创作、传播等服务，因此第35类是自媒体行业最关键的商标类别之一，注册第35类商标可以保护自媒体品牌的核心服务内容，避免其他商家或个人侵犯自己的品牌权益，除了第35类商标外，自媒体行业可能还需要注册其他相关类别，比如第42类（网站开发维护等技术服务）等，以增强自身的知识产权保护力度。

建议自媒体在注册商标之前进行全面的市场调研，咨询专业的商标代理机构或律师，选择最适合自己的商标注册方案。