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通过个人支付宝注册企业支付宝子账号，可能会有以下影响。
1、功能限制：企业支付宝子账号会继承主账号（个人支付宝）的一些功能，但由于其为企业使用，可能会受到一些功能限制，比如转账额度、提现规则等，具体限制取决于支付宝的政策和规定。
2、认证问题：注册企业支付宝需要提供企业的相关资质证明，如营业执照等，如果使用个人支付宝注册企业支付宝子账号，可能需要额外提供企业的认证信息，以确保企业支付宝的合规性。
3、风险增加：如果企业支付宝子账号用于非法活动或存在违规行为，不仅会影响该子账号的正常使用，还可能影响个人支付宝主账号的使用，企业支付宝与个人支付宝在法律责任上有所不同，如果发生纠纷或违法行为，可能需要承担相应的法律责任。
4、资金管理：企业支付宝的资金需要遵循相关的财务规定进行管理，如果使用个人支付宝注册企业支付宝子账号，可能会对企业的资金管理带来不便。
通过个人支付宝注册企业支付宝子账号可能存在诸多风险和不便利之处，建议企业在需要注册企业支付宝时，按照支付宝的规定和要求，提供真实的企业信息和资质证明进行注册，如果您已经通过个人支付宝注册了企业支付宝子账号并遇到了问题，建议尽快联系支付宝客服进行咨询和解决。