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注册三个公司不能注册的原因可能有以下几点。
1、超出注册数量限制：一些行业或地区对于个人或企业注册公司的数量有限制，超过这个限制就不能再注册新的公司。
2、名称重复或类似：如果三个公司的名称过于相似或重复，可能会导致混淆和误解，不利于公司之间的区分和市场识别，相关机构可能不允许注册名称重复的公司。
3、违反法律规定：如果注册三个公司涉及违反相关法律规定的行为，如虚假注册、违规经营等，那么相关机构将不会允许其注册。
具体情况需要根据当地的法律法规和政策来确定，如果您有具体的注册需求，建议咨询当地相关部门或专业律师以获取准确的信息和建议。