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公司注册公众号是免费的。无论是通过微信企业版还是通过微信公众号官网注册，都是免费的。不过，虽然注册是免费的，但公众号在运营过程中可能会涉及到一些费用，如认证费用、服务器费用、开发费用等。因此，在注册公众号之前，建议了解相关费用并做好预算。

仅供参考，建议查阅微信公众号官网获取最准确的资讯。