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注册100万的公司可以注册为小规模纳税人也可以注册为一般纳税人。两者并不是根据注册资本来决定的，而是由公司的实际经营规模和应税行为决定的。因此，无法单纯通过公司的注册资本来判断其是小规模纳税人还是一般纳税人。

小规模纳税人是指年应税销售额不超过500万的增值税纳税人，而一般纳税人则是超过此限额或者符合其他认定标准的纳税人，建议咨询专业的税务人员或者律师，根据公司的具体情况进行税务登记和纳税申请。