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出售厂房时，土地增值税的计算依据规定如下。
1、计算增值额，增值额是指转让房地产取得的收入减除规定的房地产开发成本、费用等支出后的余额。
2、计算应纳税额，应纳税额的计算公式为：应纳税额 = 增值额 × 适用税率，这里的税率分为四级，根据不同的增值额与扣除项目金额的比率来规定不同档次的税率。
3、扣除项目金额包括取得土地使用权所支付的金额、房地产开发成本、房地产开发费用等，这些项目都需要有合法的凭证或规定比例作为扣除标准。
具体的土地增值税政策可能因地区和时间的不同而有所调整，建议在操作前详细咨询当地税务部门或专业税务人员，以确保准确理解和遵守相关法规。