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公司注册100万每年的税收金额取决于多种因素，包括公司的类型、具体的业务、所在行业的税收政策等。以一般常见的情形来说，大致情况如下。
1、企业所得税：针对企业的盈利部分，根据一定的税率进行计算，假设公司盈利为20万，那么所得税为盈利的25%，即5万，如果盈利超过该数额，则按相应比例递增，如果盈利为负（即亏损），则无需缴纳企业所得税。
2、增值税：根据公司的业务类型及销售额计算，如果公司属于应税服务销售额在年销售额超过小规模纳税人标准（通常为年销售额不超过500万元），税率为服务销售额的6%~13%（具体税率取决于服务类型），假设公司的服务销售额为每年500万，那么增值税大约为销售额的6%~13%，即大约30万~65万，此外还有其他税种如印花税等需要考虑。
如果公司注册时的注册资本为一百万，每年可能需要缴纳的税款大约在数十万到几百万不等，具体数额需要根据公司的具体情况来计算，建议咨询专业的税务顾问或会计师以获得更准确的税务计算，同时请注意，税收政策可能随时间发生变化，请以最新的税收政策为准。