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注册一个100万的公司，涉及的资金主要用于注册资本的缴纳。具体来说，这笔钱会交给公司的注册登记机关，通常是当地的工商局或市场监管部门。完成注册后，这笔钱会存入公司在银行开设的基本账户中。
关于注册公司的流程和资金问题，可以进一步详细解释如下：
1、注册流程：首先需要进行公司名称的核名，确认名称可用后，准备相关材料提交给当地的工商局或市场监管部门进行注册登记，其中包括股东信息、公司经营范围等，完成注册后，需要开设公司的基本账户，并将注册资本存入该账户。
2、注册资金的处理：注册公司的资金主要用于公司的运营和发展，这些资金可以用于公司初期的开支、员工工资、采购原材料等，注册资本也是公司承担债务的责任限额，一个注册资本为100万的公司，其承担债务的责任限额为100万，如果公司因为债务而面临破产，股东只需要承担这100万的限额责任。
关于注册公司的具体流程和资金的流向，建议咨询专业的法律人士或代理机构以获得更详细和准确的信息，不同地区和公司类型可能存在差异，所以最好根据实际情况进行操作。