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注册公司时，注册资本为100万和101万之间的区别在大多数情况下并不显著。主要的差异可能体现在以下几个方面。
1、承担的责任：注册公司时投入的资本代表了股东的责任限额，也就是说，公司股东承担的责任最多为他们的投资额，注册资本为100万的公司股东承担的责任最多为100万，注册资本为101万的公司股东承担的责任则为最多为101万，从这个角度看，注册资本的数额确实有影响。
2、公司的规模与信誉度：虽然注册资本不能完全代表公司的规模和信誉度，但它在一定程度上反映了公司的经济实力和偿债能力，一些业务伙伴或客户可能会参考注册资本来评估公司的实力，较高的注册资本可能会带来一些商业优势，可能有助于公司在竞争激烈的市场中获得更多的信任和业务机会。
随着工商注册制度的改革，很多地方的注册资本已经实现了认缴制，即公司设立时不需要实际缴纳注册资金，从这个角度来看，注册资本为多少只是股东承诺在公司经营过程中需要承担的最大责任额度，与实际投入的资金并无直接关系，在实际运营过程中，注册资本的差异可能并不那么重要，更重要的是如何经营公司、如何管理风险以及如何建立良好的信誉和品牌形象。
注册资本为100万和101万之间的公司在法律和经营层面上并没有太大的区别，除非有特定的业务需求或合同要求注册资本的数额，否则这种差异通常不会对公司运营产生显著影响，在选择注册资本时，公司应考虑自身的实际情况、业务需求以及长期发展策略。