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如果在12306网站上显示身份证件被注册，可能有以下几种原因。
1、证件号码已被注册：可能是你的身份证信息已经被其他人用于注册了账号，在这种情况下，可以尝试找回用户名和密码，或者联系客服协助处理。
2、个人信息被冒用：有可能是个人信息被其他人冒用进行了注册，如果确认自己没有注册过账号，建议及时联系相关部门进行身份核实，并尝试联系12306客服进行申诉，以确保个人信息安全。
3、系统错误或网络问题：也可能是系统错误或网络问题导致的误报，可以尝试清除浏览器缓存或更换网络环境，然后重新尝试操作。
如果确认自己的身份证被别人注册了账号，需要立即联系相关机构并采取必要措施保护个人信息和权益，也需要注意个人信息保护，避免个人信息泄露和滥用。