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微信辅助注册失败是会计入次数的。一般来说，辅助注册的账号如果出现失败的情况，系统会计入失败次数，并且可能会对后续再次尝试产生影响。但具体的次数限制和后续影响可能会因微信系统的不同版本或更新而有所变化。

如果频繁出现辅助注册失败的情况，建议联系微信客服了解详细情况，并寻求帮助解决问题，使用微信时请遵守相关规则，确保账号安全，如有更多疑问，也可咨询微信官方客服以获取最准确的信息。