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注册公司然后转让是合法的。
1、在公司转让前，应当了解公司的资产状况，并确保公司的资产权属清晰，以避免在转让过程中出现权属纠纷，应对公司的债权债务情况进行调查，确保公司没有遗漏的债务或未解决的债权纠纷。
2、公司转让必须依法进行，并遵循公司章程的规定，在转让过程中，应当遵守法律法规，确保转让合同的合法性和有效性，还需要办理相关的手续和批准程序，如工商变更登记等。
3、在签订公司转让协议时，应当明确约定转让双方的权益和义务、转让价格、支付方式等关键内容，双方应充分了解协议条款，并确保协议内容合法、合理。
4、在公司转让完成后，应及时办理相关的证照变更和备案手续，如工商营业执照、税务登记证等，还需要办理与转让相关的其他手续，如土地使用权证、资质证书等。
只要遵守法律法规和公司章程的规定，注册公司然后转让是合法的，但在实际操作中需要注意相关事项和细节问题，以确保转让过程的顺利进行，如有疑问或需要更详细的法律建议，建议咨询专业律师。