厂房出售的纳税问题涉及多个税种，主要包括增值税、附加税、印花税、企业所得税和土地增值税。具体的纳税方式和税额计算方式如下。
1、增值税：如果厂房已经使用超过两年，出售时免征增值税，如果未满两年，税率通常为总金额的万分之五，增值税的附加税也需要缴纳，附加税包括城市维护建设税、教育费附加税等，具体金额根据当地政策而定。
2、印花税：厂房交易的印花税税率一般为总金额的万分之五，如果合同金额是固定的，那么印花税金额也是固定的，如果合同金额不明确，则按照评估价格计算印花税，买卖双方都需要缴纳印花税。
3、企业所得税：企业所得税是根据整个公司的盈利状况来计算的，一般为利润的百分之二十五，如果厂房是公司出售的固定资产，那么需要开具发票并计算企业所得税，如果是公司出售闲置的厂房土地等不动产，则需要按照转让价格与购买价格之间的差额来计算企业所得税，如果无法提供完整的账目和凭证等计税依据，可以按照纳税评估方法进行计税。
4、土地增值税：土地增值税是对土地使用权转让及出售建筑物时所产生的价格增值额进行征收的税种，具体的税额计算方式需要根据当地的政策来确定，如果无法提供扣除项目金额的相关凭证资料，无法确认评估价格评估增值等情况时，可以采用核定征收方式计算土地增值税，具体的核定征收率取决于当地税务部门的规定。
厂房出售的纳税问题需要根据具体情况进行计算和缴纳，建议在出售前咨询专业的税务人员或机构进行详细的咨询和规划。
