在公司注销过程中，注册资金为1000万并不会带来特定的弊端，但需要注意一些与注册资金相关的细节。
注册资金是公司承担责任的限额，反映了公司的经济实力和对外承担责任的限额，注销公司时，注册资金可能会被考虑在清算过程中，如果公司存在未清偿的债务或需要承担其他经济责任，注册资金可能会被用来承担相应的债务清偿，注销公司时需要注意处理好与注册资金相关的债务问题。
注销公司需要按照一定的程序和规定进行，包括清算、公告、税务注销等步骤，在这个过程中，注册资金的处理需要符合相关法律法规的规定，确保合法合规，如果处理不当可能会导致一些法律风险和纠纷。
注销公司还需要考虑其他因素，如税务、财务等方面的影响，税务方面，公司需要清算税务并缴纳相应的税款，注册资金可能会影响税务清算的结果，财务方面，公司需要处理好与资产、负债等相关的财务问题，确保财务清算的准确性和完整性。
注册资金为1000万在注销公司时并不会带来特定的弊端，但需要注意处理好与注册资金相关的债务问题，并确保注销过程符合法律法规的规定，同时还需要考虑其他因素如税务、财务等方面的影响，建议在注销公司前咨询专业人士的意见和建议，以确保注销过程的顺利进行。
