如果在使用公司名义注册的抖音账号被指控侵权，这涉及到一系列的法律问题，需要谨慎处理。以下是一些建议。
1、立即停止侵权行为：如果收到侵权警告或诉讼通知，首先要做的就是停止一切可能的侵权行为，包括删除或修改可能构成侵权的抖音内容。
2、寻求法律咨询：尽快寻求专业的法律顾问或律师的帮助，以了解具体的法律风险和责任。
3、收集证据：准备和收集所有与抖音账号相关的证据，包括账号注册信息、发布的内容、评论、互动等，以证明自己的立场和应对可能的指控。
4、与对方沟通：在律师的建议下，可以尝试与对方进行协商，寻求和解的可能性，如果侵权指控是合理的，可以尝试达成赔偿或其他形式的和解协议。
5、应对诉讼：如果协商无果，可能需要通过法律程序来解决争议，在这种情况下，需要按照法律程序的要求行事，并请律师提供专业的法律建议。
6、反思并改进：无论结果如何，都需要反思这次事件的原因和教训，以防止类似的事情再次发生，可能需要重新审视公司抖音账号的管理和使用方式，确保遵守所有的法律法规。
建议仅供参考，具体的法律策略应根据实际情况和律师的专业建议来确定，请务必谨慎处理此类问题，避免可能的风险。
