对于公司注册实名认证所需的应用程序，不同地方和机构可能有不同的要求。一般来说，工商注册实名认证常用的软件包括以下几种。
1、工商注册实名认证APP：这是工商局官方推出的应用程序，用于企业注册过程中的实名认证，该应用提供了便捷的身份验证服务，确保了企业注册的真实性和合法性。
2、支付宝、微信等支付平台的商家认证：对于某些行业或业务场景，可能需要在支付宝或微信等支付平台上进行商家认证，这些平台也提供了实名认证服务，可以方便地验证个人或企业的身份。
3、企业信息查询软件：如企查查、天眼查等软件，这些软件可以帮助您查询企业的注册信息、法人代表、股东信息等，同时也可以在软件上进行实名认证。
具体使用哪个软件取决于您的需求和所在地区的要求，建议您在选择软件时，注意软件的官方认证、用户评价、数据安全等方面，确保选择安全、可靠的软件，也建议您在下载和使用软件时，注意保护个人信息和隐私。
