注册公司和申请个体经营营业执照之间存在明显的差异，主要表现在以下几个方面。
1、性质不同：公司是指有限责任公司，是一种企业组织形式，由独立的法人实体设立，而个体经营营业执照则是个体经济组织的身份和经营权的证明，通常是由个人或家庭进行投资并直接经营。
2、责任不同：有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任，而个体经营营业执照的持有者需要承担无限责任，即承担全部经营风险。
3、投资者不同：公司的投资者可以是多人，股东可以是自然人、法人等，而个体经营营业执照的持有者主要是自然人或以家庭为单位进行投资。
4、成立条件不同：注册公司需要满足一定的成立条件，包括股东、资本、章程等要求，而申请个体经营营业执照相对简单，只需要满足一定的资金和经营场所要求即可。
5、税务和费用不同：公司在税务方面需要遵守较为严格的规定，包括企业所得税、增值税等，而个体工商户在税务方面相对较为简单，但需要缴纳个人所得税和其他相关费用，公司在注册时需要支付一定的注册资本和费用，而个体工商户的投资相对较小。
注册公司和申请个体经营营业执照在性质、责任、投资者、成立条件以及税务和费用等方面都存在明显的差异，选择哪种形式需要根据自身的需求和实际情况进行考虑和决策，如有更多疑问，建议咨询专业的法律人士或机构。
