注册12306时提示证件已经被注册，可能有以下几种原因。
1、您的身份证可能已经被别人注册过了，这种情况可能是由于您的身份证信息被他人冒用，或者您的身份信息被泄露并用于非法注册，您可以尝试找回用户名和密码，或者联系客服部门寻求帮助。
2、您的证件可能已经被注册过铁路会员账号，且账号处于停用状态，在这种情况下，您可以尝试找回用户名和密码，或者联系客服部门了解如何重新激活账号，停用状态的账号也可以尝试注销后重新注册。
3、如果您使用自己的手机号码帮助他人注册过账号，那么再次注册时也可能遇到证件被注册的问题，这种情况下，建议您尝试联系客服部门寻求帮助。
为了解决这个问题，您可以尝试以下几个步骤：
1、确认您的身份信息是否已经被注册，可以通过找回密码的方式尝试找回已有的账号。
2、联系客服部门，您可以拨打铁路客服电话或前往铁路车站窗口寻求帮助，他们会协助您解决问题。
3、如果您的证件确实已经被别人冒用注册了账号，应及时向公安机关报案，并联系铁路客服部门进行处理。
无论哪种情况，都建议您保护好自己的个人信息，避免信息泄露和被盗用，也要注意账户安全，避免账户被他人非法使用。
