注册公司资金为50万和100万在交税方面确实存在一些差异，主要体现在以下几个方面。
1、注册资金不同导致的印花税差异：注册公司时，需要按照注册资金的一定比例缴纳印花税，如果注册资金为100万，相对于50万来说，印花税会更多。
2、所得税征收的差别：企业所得税的征收与公司的利润有关，与注册资金关系不大，无论注册资金是50万还是100万，所得税的征收都是基于公司的实际盈利情况，注册资金可能会影响公司的整体运营和盈利能力，从而间接影响所得税的缴纳。
3、承担责任的差异：虽然从交税的角度来看，注册资金多少对于企业责任的影响并不直接，但在法律上，有限责任公司的股东以其认缴的出资额或认购的股份为限对公司承担责任，注册资金越多，股东在承担公司风险和责任时可能需要承担的部分就越多，但这与税收没有直接关系。
注册公司资金为50万和100万在交税方面的主要差异在于注册时需要缴纳的印花税，而所得税的征收则主要取决于公司的实际盈利情况，不过需要注意的是，以上内容仅供参考，具体的税务政策可能会因地区和行业而有所不同，建议咨询专业的税务人员或机构以获取最准确的信息。
