在注销公司时，注册资本的处理方式取决于公司的具体情况。一般来说，有以下几种处理方式。
1、以公司剩余财产分配的方式处理：在公司注销前，应首先清偿公司的债务，包括支付员工工资、社会保险费用等，在清偿完所有债务后，如果仍有剩余的注册资本，这些剩余财产可以按照股东出资比例或者公司章程规定的分配方式进行分配。
2、如果公司存在未分配完的财产或资产不足以分配的情况下，股东应当依法承担相应的责任和义务，这意味着股东可能需要以个人财产来承担公司的债务，如果公司注册资本没有完全缴纳，那么在注销公司时，股东还需要补交相应的注册资本。
3、如果公司存在虚假注册资本的情况，那么在注销公司时需要面临虚假出资的风险，在这种情况下，股东需要承担相应的法律责任，并可能需要承担额外的罚款或其他处罚，在注销公司之前，需要确保所有的注册资本都是真实的并且已经缴纳完毕。
在注销公司时处理注册资本需要根据公司的具体情况进行决策和处理，建议在处理之前咨询专业的律师或会计师的意见和建议，以确保合法合规地处理公司的注册资本和其他资产。
