注册公司和注册个体工商户之间存在以下主要差异。
1、组织形式与所有权：个体工商户是非自然人或非组织的实体形式，不能转让和继承，而公司则是法人实体，具有独立的法律地位，可以设立分公司和股东等，公司的所有权可以依法进行转让和继承。
2、投资主体与责任承担：个体工商户的投资主体只能是自然人或者家庭，其承担的是无限连带责任，而公司的投资主体可以是自然人、法人和其他组织等，股东承担的是有限责任，这意味着个体工商户的债务需要由个人资产来承担，而公司的债务则由公司资本来承担。
3、注册资金要求：注册个体工商户不需要注册资金，而注册公司时需要根据其从事的业务类型确定最低注册资本，个体工商户的经营资金可以由个人自由支配，而公司的资金则需要按照公司法规定的方式使用和管理。
4、税收政策不同：个体户缴纳的是个人所得税，而公司缴纳的是企业所得税，个体户的征税固定在一定范围内，超过范围则需缴纳相应的税款；而公司征税则根据公司的实际经营情况和盈利状况而定。
注册公司和注册个体工商户在所有权、投资主体、责任承担、注册资金要求和税收政策等方面存在明显的差异，投资者应根据自身需求和实际情况选择合适的注册形式。
