注册一百万的公司实际缴纳的税款需要根据公司的具体情况、所在行业和地区、税务政策等多种因素综合考虑。
公司需要缴纳的税种包括增值税、企业所得税、个人所得税等，增值税是根据公司的销售额和应税服务收入来计算的，企业所得税是根据公司的利润来计算的，个人所得税则是针对公司员工的工资收入来征收的。
以一家新成立的小规模纳税人公司为例，如果年营业额在100万元左右，那么可能需要缴纳的税款包括增值税、附加税、企业所得税等，增值税的税负率大约在3%左右，也就是需要缴纳约3万元的增值税，还需要缴纳附加税约几百元到几千元不等，以及根据利润来计算的企业所得税，如果公司利润不高，可能可以享受小微企业税收优惠政策，减免部分税款。
注册一百万的公司实际缴纳的税款需要根据具体情况而定，建议咨询专业的会计师或税务师，以获取更准确的税务规划和咨询服务。
