如果在注册12306时遇到提示电话号码已经被注册的情况，可以采取以下步骤进行处理。
1、确认号码是否确实已被注册：可以通过拨打其他相关服务热线或联系客服确认自己的手机号是否真的已经被注册过，有时候可能是诈骗信息或误操作导致的误判。
2、找回账号：如果确认自己的手机号已经被注册，可以尝试通过找回密码的方式找回账号，在登录界面选择“忘记密码”，然后通过手机号找回，按照流程操作即可。
3、联系客服：如果无法找回账号或解决问题，可以通过12306的官方客服电话或在线客服进行咨询，他们会提供更具体的解决方案。
4、前往火车站售票窗口：如果以上方法都无法解决问题，可以前往火车站售票窗口，携带有效身份证件和手机号码，向工作人员说明情况并请求协助解决问题。
在处理过程中，需要注意保护个人信息和账户安全，避免泄露密码和验证码等敏感信息，防止被不法分子利用，如果怀疑存在账号被盗用的情况，应及时报警并联系相关部门进行处理。
