在上海，公司注册地址与经营地址不一致的情况是被允许的，但需要注意以下几点。
1、合法性：要确保公司注册地址和经营地址的使用都是合法的，不能违反相关法规，如果公司注册地址是虚拟的或者与实际经营业务无关，可能会被视为违法行为。
2、备案要求：如果公司地址发生变化，包括注册地址和经营地址，都需要及时向相关政府部门进行备案，否则可能会受到行政处罚。
3、合同和发票问题：公司注册地址应与其开具的发票上的地址一致，如果经营地址与注册地址不一致，需要在合同中明确说明实际经营地址，并确保发票上的地址与实际经营地址一致，避免因地址不一致引起纠纷。
4、税务问题：在税务方面，公司需要确保其纳税地点与其经营地址一致，如果公司在不同地方有经营活动，可能需要办理税务登记变更手续。
5、商业信誉和形象：虽然法律允许公司注册地址与经营地址不一致，但如果频繁变更地址或存在多个地址，可能会对公司的商业信誉和形象造成负面影响，影响客户信任和业务合作。
建议公司在注册时选择与实际经营业务相符的地址，并确保在后续运营过程中遵守相关法规，及时办理地址变更手续，保持公司信息的准确性，如有更多疑问或需要了解更多细节，建议咨询专业律师或相关政府部门。
