公司注册地不在上海，但在上海缴纳保险是否有影响，需要根据具体情况来判断。
对于社保和公积金等保险，通常可以在异地缴纳，即使公司注册地不在上海，只要符合相关规定和流程，员工在上海缴纳这些保险是没有问题的，这样可以为员工提供必要的保障，不影响他们在上海的工作和生活。
但对于一些需要上海本地注册公司资质或特定政策的保险，如某些特定的商业保险或政府补贴的保险项目，可能会要求公司必须在上海注册，这种情况下，如果公司不在上海注册，可能会影响到在这些特定保险项目的缴纳和享受相关待遇。
如果公司在上海有业务开展并需要为员工购买保险，建议与公司相关负责人和人力资源部门进行沟通，了解具体的操作流程和要求，确保合法合规地为员工购买合适的保险，也可以咨询专业的保险机构或律师，以获取更详细的建议和指导。
