在深圳注册公司和东莞注册公司各有其优势和特点，具体选择取决于您的需求和业务情况。
1、深圳是中国经济特区之一，拥有完善的法律体系，有利于企业合法经营。
2、深圳毗邻香港，具有得天独厚的地理优势，便于开展国际贸易和跨境业务。
3、深圳拥有众多的高科技企业和研发机构，创新氛围浓厚，有利于科技型企业的发展。
在东莞注册公司的好处：
1、东莞作为制造业城市，拥有完善的制造业产业链和基础设施，有利于制造业企业的发展。
2、东莞的劳动力资源相对丰富，可以降低企业的人力资源成本。
3、东莞的政府政策相对优惠，例如对高新技术企业和创新项目的扶持力度较大。
如果您主要从事国际贸易、高科技研发等类型的业务，可能会更倾向于在深圳注册公司；如果您的业务主要涉及制造业和人力资源密集型产业，可能会更倾向于在东莞注册公司，您还可以根据具体的公司需求和业务情况，综合考虑两个城市的其他因素（如注册流程、税收政策等），以做出更明智的决策。
