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出售厂房的净收入应计入企业的营业外收入科目。

企业在出售厂房时，会先记录收到的款项到“固定资产清理”科目中，当清理完成后，出售厂房的总收入在扣除相关成本、税费等支出后，会记入营业外收入科目中，这个净收入并不是由企业主要的经营活动产生的，因此被归类为营业外收入。

具体的会计处理可能因企业的实际情况和所采用的会计制度的不同而有所差异，如果有任何疑问或需要更详细的会计处理建议，建议咨询专业的会计师或财务顾问。