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上海个体工商户可以通过以下步骤进行网上注册公司。
1、进入“上海市市场监督管理局官网”（http://jqsj.shsbj.cn/），点击“开办企业”进行登记注册，可使用微信扫码登录或注册账号登录。
2、在网站上填写企业相关信息，包括公司名称、法定代表人信息、股东信息、经营地址等，这些信息需要按照实际情况真实填写，同时上传相关证件的扫描件或照片，如身份证、房产证等。
3、确认信息无误后提交申请，等待工商部门的审核，审核通过后，会收到短信通知。
4、审核通过后，可以在网站上下载并打印营业执照，如果需要纸质营业执照，可以前往当地工商部门领取，还需要前往当地税务部门办理税务登记和申请发票等事宜。
需要注意的是，不同地区的具体流程和规定可能有所不同，建议在进行网上注册之前，先咨询当地工商部门或相关机构的工作人员，以确保流程正确和顺利，个体工商户在注册公司时还需要注意选择正确的经营范围和经营地址，遵守相关法律法规和规定。