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公司注册500万的年纳税金额无法直接计算，因为纳税金额与公司每年的经营状况、盈利能力以及适用的税率等因素有关。

公司需要缴纳的税种包括增值税、企业所得税等，以增值税为例，年应纳税销售额超过50万元至不超过500万元的企业，税率为一级，应税销售行为的年应税服务销售额在不超过一定限额的情况下，税率为应税服务销售额的百分之三，企业所得税则是根据企业的应纳税所得额来计算的，具体的税额取决于企业的实际盈利情况，还有其他税种如消费税、关税等，具体税额则取决于公司的业务类型和规模等因素，无法确定公司注册500万后每年的纳税金额。

建议咨询专业的税务人员或机构以获得更准确的答案。