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卖电脑的公司最怕的投诉部门取决于公司的具体情况、所在地的法规以及消费者保护法规。但一般来说，以下几个部门可能对电脑公司产生较大的影响。
1、消费者权益保护部门：这些部门负责处理消费者投诉，保护消费者权益，如果消费者对电脑公司的产品或服务不满意，他们可以向这些部门投诉，这些部门可能会对公司进行调查并寻求解决方案。
2、工商行政管理部门：这些部门负责监管市场行为，包括商业广告、合同、消费者权益保护等，如果电脑公司存在欺诈行为或其他违规行为，这些部门可能会对公司进行处罚。
3、质量技术监督部门：这些部门负责监管产品质量，如果电脑公司的产品存在质量问题，这些部门可能会对公司进行调查并要求其改进。
4、税务或法务部门：如果涉及到财务或法律问题，如偷税漏税或涉及法律纠纷等，相关部门也会对公司进行调查和处理。
电脑公司可能会害怕任何能够对其业务产生负面影响的投诉或调查，作为消费者，应该了解自己的权益，并在遇到问题时知道如何寻求帮助和解决问题。